В 1919–1920гг. возведена в сан игумении. О ее монашеском и схимнических именах знали только близкие к ней лица и большинство почитателей и после рукоположения называли ее матерью Верой

Из показаний Веры Меркуловой на следствии 1921г.:
      "...Ко мне уже около 15-ти лет ходит народ за различными советами, и я,
      по внушению свыше, говорила каждому, что ему на пользу... ".
      "Я совершенно не знаю, почему меня прозвали святой, но скажу, что я очень
       много и всегда читаю церковные книги, очень много читала Библию и жизнь
       святых апостолов. И вот, когда ко мне приходят люди и спрашивают меня,
       как жить, я им всегда разъясняю, что нужно молиться и терпеть.
       В настоящее время приходят люди — женщины и мужчины из разных деревень и
       городов — и жалуются, что их мучают, и им жить очень трудно при настоящей
       власти и говорят, что теперешняя настоящая власть от дьявола.
       Я им всегда разъясняю, что власть — от Бога, и им говорю, что в
       писании пророка Даниила в третьей книге Ездры сказано, что будут царствовать
       юнцы, старцы будут отстранены. Я всегда говорила, что нужно терпеть... ".
На вопрос, имеет ли она что-либо против Советской власти, она ответила:
      "Против Советской власти я ничего совершенно не имею. Раз в книге написано
       священной, что власть от Бога, то как же я могу против власти что-либо
       иметь?"
В августе 1920г. монастырь был закрыт, его здание и территория были переданы в 6-й отдел Социального обеспечения, и на месте был образован совхоз, где работали бывшие насельницы монастыря. Совхоз был назван "Сумароковским" — (Сумароковы — известнейшая в Костроме дворянская фамилия). Впоследствии там было размещено заведение для страдающих болезнью Дауна

После закрытия монастыря Вера Меркулова продолжала жить на его территории в особой келье вместе с монахиней Евфросинией Колбиной. Из показаний Веры Меркуловой (на допросе в 1921г., Л.144):
     "После ликвидации монастыря я была выбрана сестрами настоятельницей
      монастыря и осталась проживать при монастыре. Пятнадцать лет назад меня
      стали посещать верующие за всевозможными советами, которые я им давала...".
После тяжелой болезни в 1920г. у Веры Меркуловой отказала одна нога. Из ее показаний на следствии 1921г.:
     "От дизентерии осенью прошлого [1920] года у меня отнялась правая нога, и
      я ходила с большим трудом при помощи палки...".
Показания матушки Веры на допросе 7 августа 1920г.:
      "В настоящее время я больна, болею уже 6 месяцев и скажу, что я уже год
       как никого не принимаю к себе в келью из посетителей".
Из материалов дела 1921г.:
     "Меркулова Вера Антоновна пользуется широкой популярностью среди крестьянских
      масс под именем "Верушки" и репутацией "Святой". За советами к ней совершались
      иногда паломничества за 300 верст с приношением продуктов, одежды и проч.
      по-видимому, в очень больших размерах... Меркулова, существуя сама на эти
      приношения, наделяла и других "сестер" в монастыре и пользовалась среди
      них большим авторитетом".
Паломничество к Верушке вызывало недовольство властей. В 1920г. ее неоднократно пытались арестовать. В ее деле 1921г. имеются документы, свидетельствующие об этом. Письмо от 28 мая 1920г. в Буйское отделение милиции, в котором просили "привлечь к ответственности за агитацию против Советской власти монашенку Веру, про прозванию "Святая". Имеется Записка от 13 июля 1920г. о том, что Яхнопольский волостной милиционер "должен доставить монашенку Веру, которая выдает себя за "Святую", в Галичское милицейское управление".
19 апреля 1921г. подвижницу переселили в существовавший при доме престарелых Дом инвалидов, куда доступ был почти невозможен. На следующий день шесть сестер обители, работавших в совхозе, потребовали вернуть матушку на ее прежнее место жительства; получив отказ, сестры в знак протеста отказались выйти на работу

20 апреля 1921г. монахини и матушка были арестованы и отправлены в Галич. После побоев и издевательств при аресте у нее отказала вторая нога — она передвигалась на костылях. Теперь до конца жизни она передвигалась только с посторонней помощью. Из ее показаний на следствии 1921г.:
     "После побоев Разгуляева у меня обе ноги перестали ходить, и я уже могу
      передвигаться только при помощи двух человек...".
22 апреля 1921г. было заведено дело "по обвинению монахини Сумароковского (бывшего) монастыря Меркуловой в устройстве дебоша..."

Пока шло следствие, матушка находилась в Галичской народной больнице. Из акта медицинского осмотра Веры Меркуловой (27 апреля 1921г.):
    "Ушиб левого плеча, ссадины и небольшие кровоподтеки на теле и конечностях.
     Повреждения легкие".
Ей дана была справка:
    "Настоящим удостоверяется, что находящаяся на излечении при Галичской
     народной больнице гр-ка Вера Меркулова психически вполне здорова...".
Матушка написала просьбу-заявление отпустить ее с сестрами-монахинями в с.Высоково работать при церкви. 29 апреля 1921г. матушка и арестованные с нею сестры были освобождены под подписку о невыезде и явке в суд. Однако им не разрешили вернуться в Сумароково. Вблизи от Свято-Троицкого монастыря находилось с.Высоково, в котором ранее, во время Первой Мировой войны при помощи матушки была построена новая деревянная церковь во имя св.Михаила Архангела. Жители с.Высоково и других окрестных деревень, приняли решение:
     "Принять гражданку Веру Меркулову ... на жительство в с.Высоково..."