Был возведен в сан архиепископа указом митрополита Сергия (Страгородского)

По данным [7] — архиепископ Казанский и Свияжский — с 7 мая 1929г. В 1929г. были закрыты все монастыри. В 1930г. происходили массовые аресты и закрытие церквей. Однако в Казанской епархии больше половины церквей, особенно в сельских районах, продолжала действовать. Владыка Афанасий вместо арестованных священников рукополагал новых, возвращал на приходы тех, у кого закончились сроки лагерей или ссылок. В первые годы управления епархией он жил в Казани в Иоанно-Предтеченском монастыре. Потом проживал в доме, принадлежавшем Богоявленской церкви, которая в те годы была кафедральным собором, а после конфискации этого дома — в доме N 6 на улице Кирпичногородской

В Ташкент не выехал. 11/24 августа 1933г. назначен архиепископом Саратовским

30 августа 1935г. уволен на покой

Арестован 2/15 мая 1935г. [8]

13 сентября 1935г. Особым Совещанием при НКВД СССР приговорен к 3 годам высылки в Северный край [8]