Позднее служил в разных приходах Латвии

Во время войны рядом с Карсавой фашистами был устроен концлагерь, где было заключено около 2.000 советских военнопленных, находящихся на грани голодной смерти. О.Иоанн организовал тогда негласный комитет спасения лагерников. Он неоднократно встречался с комендантом лагеря и получил разрешение помогать заключенным продуктами, которые собирали Карсавские крестьяне, прихожане о.Иоанна. За два с половиной года, вплоть до освобождения лагеря советскими войсками, благодаря самоотверженной деятельности о.Иоанна и врача Карсавы Е.А.Мамонтовой, было спасено от смерти множество пленных. За все это время, несмотря на эпидемию тифа среди заключенных, в лагере умерло только около 40 человек