Будучи высланным в Москву, проживал здесь без права выезда. В это время Патриарх Тихон предпринимал хлопоты, касающиеся легализации Синода Русской Православной Церкви, во Временный состав которого был включен и епископ Прокопий. Но с учреждением Синода вопрос не был окончательно разрешен, т.к. 7 апреля 1925г. Святейший Патриарх Тихон скончался. На погребении Святейшего Патриарха епископ Прокопий служил панихиду с сонмом духовенства. Он присутствовал при оглашении завещания Святейшего Патриарха Тихона и вместе с другими иерархами Русской Православной Церкви 12 апреля 1925г. подписал акт о передаче высшей церковной власти Патриаршему Местоблюстителю митрополиту Крутицкому Петру (Полянскому), в соответствии с завещательным распоряжением почившего Патриарха. Вместе с некоторыми другими архиереями епископ Прокопий принимал активное участие в помощи Местоблюстителю Петру (Полянскому) в делах по управлению Русской Православной Церковью