Хиротонисан во епископа Петропавловского, второго викария Владивостокского и Камчатского епископа с пребыванием в г.Петропавловске с правами полусамостоятельного управления епархией в силу особых условий положения Камчатской обл. Вечером того же дня был получен указ Святейшего Синода: "Архиепископу Евсевию Вдадивостокскому и Камчатскому о бытии архиепископом Приморским и Владивостокским, а епископу Петропавловскому о бытии епископом Камчатским и Петропавловским с самостоятельным управлением Камчатской епархией и с жительством в Петропавловске-Камчатском

7 июля 1917г. в Петропавловске большинством голосов епископ Нестор был избран делегатом Священного Собора 1917–1918гг. вместе с мирянином Иваном Трофимовичем Новограбленовым. Кроме того, епископ Нестор имел голос на Соборе, как правящий епископ

В конце 1917г. после октябрьского переворота написал и опубликовал (по благословению Святейшего Собора) брошюру "Расстрел Московского Кремля" с фотоснимками разрушенных кремлевских святынь. Декабрь 1917г. — февраль 1918г. — участвовал в заговоре по спасению Царской семьи

В ночь на 1 марта 1918г. (н.ст.) был арестован

Был заключен в Политотдел штаба Красной армии (здание бывшего Александровского военного училища), затем переведен в Таганскую тюрьму

Из Таганской тюрьмы владыка Нестор был переведен в Новоспасский монастырь. 2 марта 1918г. состоялось заседание Священного Собора, посвященное аресту епископа Нестора

25 марта 1918г. (н.ст.) владыка был освобожден