Митрополит Алексий назначил о.Владимира настоятелем Князь-Владимирского собора, где тогда находилась чудотворная икона Божией Матери "Скоропослушница". Это место занимал малообразованный человек, который, хотя и понимал, что занимает его не по праву, но был огорчен предстоящим смещением. О.Владимир, боясь нанести ему рану, отказался от настоятельства под предлогом болезни. Но голодное время заставило пойти на работу — сторожем кладбища. Поняв причину отказа, митрополит предложил ему служить в Шувалове под Ленинградом

Поначалу о.Владимир жил в сторожке. Позже, когда вернулась семья, жили в холодном помещении. И уже много позже в долг была куплена половина дома. Настоятель храма в Шувалове, будучи благочинным загородных храмов, почти всегда отсутствовал, дела по храму вел о.Владимир, сам исполнял "черные" работы, иногда ночью. Каждый день с утра до вечера находился в храме (по обещанию Богу, когда возвращался из заключения).
   К деньгам он относился так: "Господь дает их в избытке для того, чтобы делиться с другими. Надо давать их людям по потребностям; давать просто, не жалея, не гордясь, не напоказ, а во славу Божию".
   Умирая, Вырицкий старец о.Серафим утешал своих близких: "Не плачьте, у вас остаются два больших светильника: о.Владимир (Шамонин) и о.Борис" (протоиерей о.Борис — настоятель храма Петра и Павла в Санкт-Петербурге).
   В 1961г. с о.Владимиром случился инфаркт. Пришлось уйти из храма и стать заштатным священником

После выхода на пенсию о.Владимир продолжал посещать Спасо-Парголовский храм, причащал, исповедовал. В храм дочери возили его на такси, ходить не мог — болезнь ног, полученная в заключении. Физические силы иссякали, храм посещать стало трудно. Дома читал, писал, молился, принимал прихожан — они по-прежнему шли к своему любимому батюшке