Уфимской епархией в это время временно управлял епископ Давлекановский Иоанн (Поярков), который с конца 1924г. изменил Патриарху Тихону, прекратил поминовение его имени за богослужением, позволил себе критику действий Патриарха в советской печати; к 1926г. определилась его линия на открытое сближение с обновленцами; епископ Иоанн перешел и допустимую (по мнению Владыки Андрея) границу в сотрудничестве с Советской властью. Поэтому по приглашению верующих Градо-Уфимской Симеоновской Александро-Невской церкви Владыка Андрей начал служить в этом храме как кафедральном храме уфимских православных староцерковников патриаршей ориентации. Таким образом, в противовес "иоанновскому" течению, которое его противники считали полуобновленческим, образовалось "андреевское" автокефальное течение, сторонники которого не признали прав митрополита Сергия (Страгородского) на руководство Русской Церковью и резко выступили против его "Декларации" от 29 июля 1927г. Владыка Андрей воспитал в Уфимской епархии целую плеяду мучеников и исповедников. 13 июня 1927г. епископ Андрей по вызову ОГПУ выехал из Уфы в Москву, где был арестован и осужден