Был обвинен в том, что "1) входил в состав контрреволюционной монархической организации; 2) руководил нелегальным сестричеством при Свято-Духовской церкви и организовывал денежные сборы для заключенных; 3) вел систематическую антисоветскую агитацию".
При обыске у о.Николая нашли портреты сосланных священников и архиепископа Серафима (Самойловича)