В 1920г. был возведен в сан архиепископа

Был арестован Полоцким губернским революционным трибуналом по делу о сопротивлении изъятию церковных ценностей, за распространение воззвания Патриарха Тихона и проведении собрания духовенства по этому вопросу. Очевидно, что преследовалась только одна задача: устранение от управления епархией столь авторитетного архиерея для создания раскола в епархии

В Витебской тюрьме владыка заболел паратифом, начал бредить. И тюремный врач, и следователь почему-то приняли его за сумасшедшего, после чего перевели Владыку в психиатрическую больницу. Это его и спасло: когда за ним приехали из ОГПУ, то врачи ответили, что Ястребов в буйном помешательстве и к нему нельзя подойти. А на самом деле он был уже здоров. Впоследствии монахиня Талида, сопровождавшая владыку в ссылке, приводила рассказ самого врача:
    "Мы были потрясены, когда увидели на владыке вериги (тяжелый серебряный
     параман и тяжелый серебряный крест. Мы прекрасно поняли, что это
     не психиатрическое заболевание, а тиф.
     Когда температура спала, то из тюрьмы приехали ночью явно взять владыку
     на расстрел. А мы говорим:
         "Что вы, он в клетке, он буйно помешанный, в смирительной рубашке, мы боимся подойти".
А психически больные утром выстраивались в очередь за благословением, как они выражались, "к Великому". И один больной написал даже книгу:
    "Что мы пережили, когда к нам приехал Великий"

Последней тюрьмой, в которую перевели владыку, была Калининская (Тверская). Она располагалась в Отрочем монастыре. Владыка, по его словам, имел счастье быть в той келье, в которой принял мученическую кончину святой митрополит Филипп (Колычев) от руки опричника Малюты Скуратова, когда царь Иоанн Грозный проезжал Тверь. Из Тверской тюрьмы владыка был освобожден, получив "минус шесть", то есть он мог жить на свободе, исключая шесть городов. Поскольку в это время у владыки было сердечное заболевание, то он получил назначение правящим архиереем в Кисловодск