В 1923–1924гг. Иван Матвеевич являлся членом православной тихоновской общины и членом церковного совета при единственной действовавшей на территории разоренного Тихвинского Богородицкого монастыря церкви, называемой "Крылечко", превращенной в приходскую. В этой церкви находилась чудотворная Тихвинская икона Божией Матери. Тихвинская обитель с ее настоятелем владыкой Антонием (Демянским) стала единственным оплотом православия в г.Тихвине, т.к. все остальные храмы были к тому времени захвачены обновленцами. В сентябре 1924г. Череповецкий губиспоком принял решение о передаче обновленцам последней действующей церкви монастыря "Крылечко"

11 сентября 1924г. в монастырь прибыла группа обновленцев во главе со священником Леонидом Борисовым и другим священником обновленческого толка Мальцевым с целью захвата церкви "Крылечко". Однако занять церковь в этот день им не удалось. Возмущение людей действиями властей и обновленцев было так сильно, что разогнать толпу собравшихся удалось только силами воинских частей Тихвинского гарнизона. Сопротивление верующих 11 сентября было названо властями "подготовленным собранием к/р характера", епископ Антоний был объявлен его "вдохновителем и организатором", а Иван Матвеевич Аплонов и еще несколько тихвинских горожан знатного происхождения, входивших в члены церковного совета и православной общины при Тихвинском монастыре — участниками к/р церковной группы под руководством епископа Антония. Они были арестованы вместе с владыкой Антонием и проходили с ним по одному делу

Групповое дело "Дело епископа Антония (Демянского) и др., Новгородская губ., г.Тихвин, 1924–1925гг." 

Архив УФСБ по Санкт-Петербургу и области. Д.П-90548. И.М.Аплонов и все проходившие по делу виновными себя не признали и были приговорены к 3 годам концлагерей (владыке Антонию концлагерь был заменен ссылкой на тот же срок ввиду состояния здоровья). Дальнейшая судьба неизвестна