После отбытия ссылки архимандрит Владимир вернулся к брату в Смоленскую губернию. Здесь его нашли два делегата от Барнаульского епархиального съезда и сообщили, что съезд единогласно избрал архимандрита Владимира Барнаульским епископом. В марте 1927г. он выехал в Москву, где состоялась его хиротония во епископа. При хиротонии он дал обещание не признавать Временный высший церковный совет (ВВЦС) — марионеточный обновленческий орган, созданный чекистами в противовес "староцерковникам"

В Барнауле (по сведениям чекистов) заявил, что ВВЦС — "организация неканоническая, самочинная и патриархом запрещенная".
С его приездом приходы, уклонившиеся в григорианство, вновь воссоединились с Матерью Церковью

При аресте Владыке Владимиру было предъявлено обвинение по ст.58–14 и ст.58–18 УК РСФСР