Служение
Псковская о., Новосокольнический р., погост Спастер, Покровская церковь 
монахиня 
Должность член церковной общины 
Год окончания 1937 
Монахиня Иоанникия никогда не скрывала своей принадлежности к монашескому сословию.
В д.Рижицы монахиня Иоанникия вошла в небольшую церковную общину, которая
собиралась на приходе тайно в разных домах.
Молились, читали слово Божие, святых отцов, слушали рассказы о подвижниках
благочестия.
Окормлялась община протоиереем Василием Цыганковым — настоятелем Покровской церкви
соседнего села Спастер, который, по ее словам, был для нее
"самым близким человеком из земных"

Аресты
Псковская о., Новосокольнический р., д.Рижицы 
Год ареста 1937 
День ареста 12 
Месяц ареста 8 
12 августа 74-летняя старица была арестована.
Она к этому времени была тяжело больна, страдала многими болезнями
и в том числе пороком сердца, о чем тюремный врач сделал медицинское заключение.
Список изъятых вещей при обыске по описи:
     "Две фотографии лиц в монашеской одежде, в том числе изображение
      о.Иоанна Кронштадтского;
      "святая молитва, перепечатанная [разрешительная молитва];
      поздравление протоиерея Иоанна Кронштадтского;
      воззвание к народу о посещении церкви;
      шесть фотокарточек святых"

Судя по тому, что монахиня Иоанникия хранила при себе разрешительную молитву
которая полагается в гроб усопшему по окончании чина отпевания, она готовилась
к исходу из земной жизни
Осуждения
тройка при УНКВД СССР по Калининской обл. 
21/08/1937 
Обвинение "член к/р церковной группировки, антисоветская агитация" 
Статья ст.58–10 ч.1 УК РСФСР 
Приговор=высшая мера наказания — расстрел 
Групповое дело "Дело протоиерея Василия Цыганкова, монахинь Ирины (Бойко) и Иоанникии (Шапкиной), Псковская о., пог.Спастырь, 1937г."  
Из обвинения:
     "...Состояла членом контрреволюционной церковной группы...
      Систематически вела антисоветскую агитацию против политики Соввласти и
      ее мероприятий, проводила контрреволюционные сборища антисоветского элемента".

Мать Иоанникия признала, что была членом церковной общины, что "мы все вместе
слушали по воскресеньям молебны в церкви и проповеди".

Обвинения в к/р агитации и к/р деятельности она категорически отвергла.
На вопрос:
     "Какую к/р агитацию проводили вы в интересах привлечения граждан в церковь?"
она ответила:
     "Отец Василий Цыганков говорил нам, что чтить Церковь надо, и кто свободен
      от работы, должен идти молиться, и Бог поможет тем, кто работает".

Из показаний свидетельницы о монахине Иоанникии и других членах церковной общины:
     "Ходили по домам к колхозникам и агитировали ходить в церковь молиться Богу,
      крестить детей, в праздничные дни не ходить на работу...".

Из показаний Марии Алексеевны Гультяевой, проходившей по делу:
     "Меня воспитали в духе монашества отец Василий Цыганков и монахиня
      Иоанникия (Шапкина)".

Из обвинения:
     "Шапкина привлекала к себе верующих и воспитывала их в монашеском духе...
      Проводила контрреволюционные сборища, где, читая Библию, доказывала,
      что "Советская власть продержится недолго", что "Все идет по Писанию Божиему"
Виновной себя ни в чем не признала