6 сентября 1918г. в "Известиях Исполкома Советов Западной области" был опубликован "Приказ о заложниках". Исполнителями приказа о заложниках и всех акций "красного террора" должны были быть местные ЧК, и даже Ревтрибуналы были признаны действующими "чересчур медленно и недостаточно репрессивно". ЧК имели право без суда и следствия арестовывать и расстреливать только на основании принадлежности к классу буржуазии всех, кого ЧК желательно расстрелять, в том числе представителей духовенства. На заседании Юхновского уездного комитета РКП(б) в первые дни сентября 1918г., был обсужден вопрос, "как реагировать на убийство товарищей Володарского, Урицкого и покушение на товарищей Ленина и Зиновьева" и было принято решение:
     "Ответить на белый террор буржуазии красным террором за смерть своих
      вождей, как реванш собрать следующих представителей буржуазии, выявивших
      себя как темные контрреволюционные элементы, и после чего расстрелять.
      Намечены следующие лица...".
Далее перечислялись поименно 15 человек, среди которых были протоиерей благочинный Павел Заболотский и священник с.Аксиньино о.Капитон Сергиевский. Этот список был передан в Юхновский уездный Исполком. Из уездного Исполкома список тех, кого надлежало арестовать, был прислан в Юхновскую уездную ЧК. Этот список содержал 17 имен тех, кого на заседании Исполкома было решено "иметь как заложников". На арест каждого из них ЧК выписала постановление следующего содержания:
     "Комиссия... рассмотрев сего числа список исполнительного комитета
      заподозренных лиц в связи с убийствами т.т. Урицкого, Володарского и
      покушением на жизнь т.Ленина, находит, что к числу заподозренных лиц
      относится и ... [такой-то], а потому, основываясь на распоряжении
      Комиссариата внутренних дел, посланного им в телеграмме за N 50150/2121
      о том, чтобы при каждом совдепе имелись заложники заподозренных лиц,
      постановила:
          Протоиерея Юхновского Казанского собора Заболотского [или другого
          заложника] заключить в Юхновскую тюрьму впредь до указания высших
          властей, куда последний должен быть направлен".
Помимо протоиерея Павла Заболотского и священника Капитона Сергиевского, в указанный "Список лиц, подлежащих задержанию и аресту" входили: Гвоздов, Данилов, А.Дунаев, И.Дурново, Ковалев, Лавровский, Лелюхин, В.Макаров, Медведев, Г.Петренко, Скрыдлов, В.Е.Солянов, Федченков, Д.Т.Чернов, И.Ястребов. 9 сентября/27 августа 1918г. уездная ЧК предписала Юхновской уездной милиции арестовать протоиерея Павла Заболотского и священника Капитона Сергиевского, равно как и еще 10 граждан Юхновского уезда. Арестовать протоиерея Павла Заболотского и священника Капитона Сергиевского, равно как и еще 10 граждан Юхновского уезда, уездная ЧК предписала Юхновской уездной милиции 28 августа/10 сентября 1918г. протоиерей Павел Заболотский был арестован вместе со своей дочерью Анной Згурской (ее вскоре отпустили) и заключен в тюрьму г.Юхнова. Священник Капитон Сергиевский был арестован 12 сентября и оказался в Юхновской тюрьме 14 сентября. Вместе со священнослужителями были арестованы еще пятеро мирян. Во всем, что с арестованными происходило, роль Юхновской ЧК оказалась второстепенной: все решения об их судьбе (аресте, заключении в тюрьму, расстреле) принимали уездный комитет РКП(б) и исполком уездного совета, ЧК в данном случае только исполняла их прямые указания. Арестованные были помещены в Юхновскую тюрьму вначале как "заложники буржуазии за смерть тов.Володарского и многих других товарищей... а также за намерение буржуазии отнять у русской революции ее голову, ее вождя товарища Ленина". Затем против них было выдвинуто обвинение в "контрреволюции"

Групповое дело "дело прот.Заболотского, свящ.Сергиевского и пятерых мирян. Юхнов, 1918г." 

Архив УФСБ по Смоленской обл. Д.3575-С. [Фонд снятых дел. "Дело с постановлениями заложников Юхновской уездной Чрезвычайной Следственной Комиссии по борьбе с контрреволюцией, спекуляцией и преступлением по должности", 1918]. По делу, кроме о.Павла, проходили о.Капитон Сергиевский и пятеро мирян. Все они были приговорены к расстрелу и расстреляны

Протоиерею Павлу Заболотскому, когда его арестовали, было уже 72 года, нахождение в тюрьме было для него по причине слабого здоровья очень тяжелым. 17 сентября он написал в ЧК оставшуюся без внимания просьбу об освобождении его из-под ареста:
     "Страдаю сердцебиением, головными болями, расстройством нервной системы,
      катаром желудка и кишок".
Безуспешно хлопотали об арестованных священниках и прихожане