Последние 13 лет жизни престарелого инока были неразрывно связаны с Псково-Печерским монастырем. Старец был назначен братским духовником, а по благословению иеросхимонаха Симеона (Желнина) он принял на себя послушание по отчитыванию одержимых злыми духами. С этого времени к о.Афиногену стало приезжать множество страждущих нередко из самых отдаленных уголков России. Одни из них страдали более физически, другие сугубо духовно, от бесов. Батюшка старался принимать и тех и других, стремясь по возможности облегчить их скорби. И немало больных действительно исцелялось. В 1970-х годах старец много и тяжело болел, но, несмотря на слабое здоровье и весьма преклонный возраст (ему исполнилось уже 90 лет), он по-прежнему неустанно продолжал свои труды по духовному окормлению как иноков Псково-Печерского монастыря, так и паломников-мирян. Примерно за два месяца до смерти, в день Святой Пасхи, старцу еще довелось участвовать в монастырском богослужении, более в этой жизни он уже не служил в Божием храме