С 1956г. пребывал на покое в мужском монастыре г.Измаила Кишиневской епархии с правом служения в городском соборе. Строгой аскетической жизнью, чуткостью и человеколюбием завоевал всеобщее уважение духовенства и мирян. 30 мая 1964г., во время пребывания Патриарха Московского и всея Руси Алексия I в Одессе, архиепископ Даниил был награжден правом ношения креста на клобуке. В 1964г. участвовал вместе с Патриархом в наречении и хиротонии архимандрита Антония (Мельникова) во епископа Белгород-Днестровского в одесском в честь Успения Пресвятой Богородицы мужском монастыре

15 октября 1964г. определением Синода новым местожительством архиепископа Даниила был определен Жировицкий в честь Успения Пресвятой Богородицы женский монастырь, однако в ноябре того же 1964 года он переехал в одесский во имя св.Архангела Божия Михаила женский монастырь в с.Александровка Одесской обл. В конце жизни он практически потерял зрение, вероятно, это было следствием его пребывания в заключении