В Москве Василий Федорович служил бухгалтером в столовой автобазы Совнаркома. Зимой 1933г. его пригласили для работы в военкомате

14 февраля он был вызван в кабинет военного комиссара, арестован и привезен на Лубянку

Проходил по одному делу с о.Павлом Флоренским, Павлом Каптеревым, Борисом Ключевским с которыми потом оказался в пересыльной тюрьме в одной камере

Василий Федорович в анкете в графе "социальное происхождение" написал: "сын мещанина". Следователь выхватил у него анкету со словами: "У нас есть данные, что ты сын купца". В это время Василий Федорович случайно увидел у следователя донос на себя и понял, по чьему доносу он арестован. Он отказался подписать анкету, и его отправили в камеру. Следователь несколько раз пытался вырвать у Василия Федоровича признание неизвестно в каких преступлениях. "Мне не в чем сознаваться", — отвечал ему Василий Федорович. В конце-концов следователь сказал ему:
   "... Я вполне согласен с прокурором, поскольку ты не сознаешься, отправить
   тебя на долгий срок, и ты уже не будешь работать бухгалтером, а будешь кряжи
   ворочать. Сейчас я отправлю тебя в Бутырки. Вздумаешь сознаться, напишешь мне,
   но не по-пустому".
Василия Федоровича перевезли в Бутырки

В то время в Бутырках была хорошая библиотека, еще с дореволюционных времен, и Василий Федорович прочитал там "Размышления о Божественной литургии" Н.В.Гоголя и др. книги. Прошло полтора месяца со дня ареста, но у следователя не было ни протокола допроса, ни подписанной анкеты. В марте 1933г. он отказался подписать также и постановление с текстом обвинения. После этого он содержался в Бутырках, будучи лишен продовольственных посылок, которые ему передавали маросейские друзья. В начале августа 1933г. ему объявили приговор "тройки" и отправили в пересыльную тюрьму

Пересыльная камера была устроена в бывшей тюремной церкви. Здесь он познакомился с другими осужденными по делу о к/р церковной организации, в которой Евдокимов якобы принимал участие. Здесь были о.Павел Флоренский, бывший профессор церковного права П.В.Идульянов, профессор МДА Н.Ф.Каптерев, сын знаменитого историка Ключевский, Кокуев, Чумичев и др. Когда Василий Федорович вошел в камеру, к нему сразу же подошел Кокуев и произнес: "Я очень перед Вами виноват, потому что, не зная Вас, я сказал, что Вы состоите в группе. Мне нужен священник, у которого я мог бы исповедоваться".
О.Павел Флоренский принял его исповедь. Позже Кокуев сказал:
   "Вы, Василий Федорович, ничего не подписали и получили 3 года, а я со всем
   согласился, и приговорили к 5 годам".
Перед отправкой на этап всех заключенных свели в одной камере. Отцу Павлу вообще не был объявлен приговор, и он узнал его только на этапе — 10 лет ИТЛ. Василия Федоровича первым забрали из Бутырок и направили в Среднеазиатское управление лагерей. В столыпинском вагоне заключенных довезли до Сызрани

В грязной Сызранской тюрьме, забитой до отказа людьми всех возрастов, со вшами и блохами, заключенных продержали неделю, а потом привезли в Ташкент на пересыльный пункт

В этой тюрьме процветали воровство и разврат. Вскоре Василий Федорович был взят в бухгалтерию. Тут оказался Иван Герасимович Сапчук, с которым Василий Федорович когда-то был на Май-Губе. Благодаря Сапчуку Василий Федорович попал в этап, который отправляли на строительство канала Москва-Волга

В заключении работал заведующим картотеки на 25 тысяч человек Южного района Дмитровского лагеря. Потом — бухгалтером одного из складов по снабжению лагерных ларьков. 13 августа 1935г. он был освобожден из лагеря и на 3 года сослан (направлен на свободное поселение) в Ивановскую Промышленную обл. в г.Ковров. По дороге он побывал в Москве, навестил всех знакомых, в первую очередь, "маросейских"

В Коврове он получил паспорт

Во Владимире прописался, но устроиться на работу было непросто, т.к. никто не хотел брать бывшего заключенного. В течение недели он разгружал зерно, после чего ему удалось устроиться бухгалтером в контору "Заготзерно".
Во Владимире он познакомился с епископом Афанасием (Сахаровым), который не принял "Декларацию" митрополита Сергия и являлся духовным руководителем "непоминающих".
Как и все "маросейские", Василий Федорович также был "непоминающим" и не посещал церквей, где возносилось имя митрополита Сергия. Знакомство с епископом Афанасием (Сахаровым) дало ему возможность участвовать в евхаристической жизни небольшой общины, образовавшейся вокруг Владыки Афанасия. Срок ссылки закончился в июле 1938г., и Василий Федорович уехал в Калинин