Указом Нижегородской Духовной Консистории от 19 июля 1913г. о.Иоанн был назначен настоятелем в один из древнейших храмов Нижнего Новгорода — церкви Успения Божией Матери, что на Ильинской Горе. Это был небольшой храм и малочисленный приход, в котором вместе с о.Иоанном служил только псаломщик. О.Иоанн состоял преподавателем в Рождественском городском начальном училище. Вошел в состав Нижегородского училищного совета. Являлся членом епархиального эмеритального управления. В 1915г. о.Иоанн овдовел, его жена Елизавета скончалась в возрасте 40 лет После кончины супруги все свои душевные и физические силы о.Иоанн обратил на плодотворную религиозно-просветительскую и проповедническую деятельность среди нижегородцев. О.Иоанн всячески помогал воспитанию внука Глеба — единственного сына дочери Елизаветы. Церковный причтовый дом, который находился рядом с храмом и где жил о.Иоанн, был большой, с винтовой лестницей, анфиладой комнат и богатой библиотекой, в которой детей его родственников особенно привлекали подшивки иллюстрированных журналов. В воскресные и праздничные дни к нему очень любили приходить малолетние племянники из семьи Никольских. После революции дом этот был национализирован, и о.Иоанну пришлось переселиться жить непосредственно при своем храме