В начале августа 1920г. епископ Варнава был переведен в Печерский Вознесенский монастырь в Нижнем Новгороде и стал старшим викарием епархии

С 20 октября 1920г. по март 1921г. находился в отпуске в Зосимовой пустыни. 20 июня 1922г. подписал резолюцию Нижегородского епископата и духовенства о признании обновленческого ВЦУ. Покаялся и понес епитимью, наложенную на него его духовным отцом, Зосимовским старцем Алексием (Соловьевым). 29 сентября 1922г. получил благословение старца Алексия на несение подвига юродства, чтобы не переходить в обновленчество, которое приняло все Нижегородское церковное руководство